課程名稱 |
傳染病分子流行病學 Molecular Epidemiology in Infectious Diseases |
開課學期 |
109-2 |
授課對象 |
公共衛生學院 流行病學與預防醫學研究所 |
授課教師 |
范怡琴 |
課號 |
EPM5024 |
課程識別碼 |
849 U0520 |
班次 |
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學分 |
2.0 |
全/半年 |
半年 |
必/選修 |
選修 |
上課時間 |
星期一6,7(13:20~15:10) |
上課地點 |
公衛208 |
備註 |
與方啟泰、施惟量、蔡坤憲合授 總人數上限:20人 |
Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1092EPM5024_ |
課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
分子流行病學研究涵蓋分子生物學和流行病學領域。本課程著重原理、應用和實作了解如何應用分子生物技術進行流行病學研究,採循序漸進方式讓學生先了解基礎微生物學、免疫學、分子生物學,接著以原理和方法應用講解如何利用分子檢測和親緣性分析探討致病原流行趨勢、來源、傳播模式,以及致病原基因特性和流行病學相關。分子檢測內容包含核?酸和非核?酸檢測方法;親緣性分析採分階段說明基礎定序原理、序列分析方式、至利用基因序列進行親緣性分析;本課程未包含流行病學研究設計和分析方法,此內容請參考「流行病學原理」課程。 |
課程目標 |
1.培養學生對微生物學、免疫學、分子生物學之興趣和奠立基礎。
2.培養學生具備設計、執行、評估及改善分子檢測方法之能力。
3.培養學生具備解讀親緣性研究之能力。 |
課程要求 |
課前至CEIBA課程網站下載投影片並在課後複習
分子檢測分析實作: 學生需備有實驗衣
親緣性分析實作: 學生需備有筆電
1次期中考: 第一至第十周課程內容
3次實作課程結果報告: 每次實作結果以電子檔繳交1張圖或表,並用一段文字解釋結果(限1張A4內)
1次期末口頭報告:以組別為單位報告傳染病分子流行病學相關文獻 |
預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
待補 |
參考書目 |
1. Riley, Lee. W. Molecular Epidemiology of Infectious Diseases: Principles and Practices. Washington, D.C. : ASM Press. (2004)
2. Murray, Patrick R., Rosenthal, Ken S., Pfaller, Michael A. Medical Microbiology; Eighth Edition. Philadelphia, Pennsylvania: Elsevier (2016)
3. Hall, Barry G. Phylogenetic trees made easy: a how-to manual; Fourth Edition. Sunderland, Mass. : Sinauer Associates. (2011)
課堂中引用之重要參考文獻會於課前上傳至CEIBA課程網站上。
Critical references will be uploaded to CEIBA before the lecture. |
評量方式 (僅供參考) |
No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
1. |
期中考 |
30% |
第一至第十周課程內容 |
2. |
實作結果報告 |
30% |
每次實作結果以電子檔繳交1張圖或表,並用一段文字解釋結果(限1張A4內),3次實作課程結果報告各佔10% |
3. |
期末口頭報告 |
20% |
以組別為單位報告傳染病分子流行病學相關文獻 |
4. |
課程參與 |
20% |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
第1週 |
2/22 |
傳染病分子流行病學歷史和應用 |
第2週 |
3/01 |
和平紀念日補假 |
第3週 |
3/08 |
細菌基因體 |
第4週 |
3/15 |
細菌毒力和抗藥性 |
第5週 |
3/22 |
病毒傳播循環和演化 |
第6週 |
3/29 |
核苷酸檢測原理和應用: 聚合酶連鎖反應檢測和實作 (I) |
第7週 |
4/05 |
民族掃墓節補假 |
第8週 |
4/12 |
核苷酸檢測原理和應用: 聚合酶連鎖反應檢測和實作 (II) |
第9週 |
4/19 |
親緣性分析和實作: 基因序列 (I) |
第10週 |
4/26 |
親緣性分析和實作: 基因序列 (II) |
第11週 |
5/03 |
期中考 |
第12週 |
5/10 |
病毒和宿主交互作用 |
第13週 |
5/17 |
非核苷酸檢測原理和應用: 抗體抗原檢驗法和實作 (I) |
第14週 |
5/24 |
非核苷酸檢測原理和應用: 抗體抗原檢驗法和實作 (II) |
第15週 |
5/31 |
專題演講:新興蟲媒立克次體病之分子與血清流行病學研究 (蔡坤憲 老師) |
第16週 |
6/07 |
專題演講:Molecular Tracing (方啟泰 老師) |
第17週 |
6/14 |
端午節放假 |
第18週 |
6/21 |
期末口頭報告 |